Implementacija HACCP sistema mora da prati sledećih sedam principa:

PRINCIP 1 - Sprovođenje analize opasnosti
Proces prikupljanja i procene informacija o opasnostima i stanjima koja dovode do njihovog prisustva, kako bi se donela odluka koje opasnosti su od značajna za bezbednost hrane i koje od njih stoga treba rešavati u okviru HACCP plana.
PRINCIP 2 - Određivanje Kritičnih kontrolnih tačaka (CCP)
Korak u kome se može vršiti kontrola, a koji je od suštinskog značaja za prevenciju ili eliminisanje opasnosti po bezbednost hrane ili smanjenje opasnosti na prihvatljiv nivo.
PRINCIP 3 - Uspostavljanje kritičnih granica
Kritična granična je vrednost (maksimalna i/ili minimalna) u kojoj izabrani parametar sme da varira, bez uticaja na bezbednost proizvoda. Kritične granice moraju da budu merljive. Kriterijumi koji se često koriste su merenje temperature, vremena, nivoa vlage, pH vrednost, Aw, senzorne osobine (vizuelni izgled, tekstura…). Kritične granice za upravljanje opasnostima u CCP, definišu se na osnovu predhodnog iskustva, naučne literature, znanja, preporuke stručnjaka, zakona, pravilnika i sl.
PRINCIP 4 - Uspostavljanje sistema za praćenje kontrola svake CCP
Praćenje podrazumeva merenje parametara ili posmatranje CCP u njenim kritičnim granicama. Sistem praćenja se uspostavlja za svaku CCP.
PRINCIP 5 - Uspostavljanje korektivne mere koju treba preduzeti kada praćenje ukaže da je neka CCP izvan kontrole.
Bilo koja mera ili aktivnost koja se može preduzeti za eliminisanje opasnosti vezane za bezbednost hrane ili njeno smanjenje na prihvatljiv nivo.
PRINCIP 6 - Uspostavljanje postupaka za verifikaciju kako bi se potvrdilo funkcionisanje HACCP sistema.
Za utvrđivanje funkcionisanja HACCP sistema koriste se metode verifikacije i provera (internih i eksternih), kontrolisanja i ispitivanja, uključujući i nasumično periodično uzorkovanje i analize.
PRINCIP 7 - Uspostavljanje dokumentacije vezane za sve postupke kao i zapisa koji odgovaraju ovim principima i njihovoj primeni.
Sve aktivnosti koje se preduzimaju u HACCP sistemu moraju biti planirane, dokumentovane i o njima se moraju voditi zapisi, kao dokaz o preduzetim aktivnostima.